La fonction des isolants est directionnelle, comme l'ont découvert les expériences sur les mouches des fruits. gypsy a été inséré dans le locus jaune y de Drosophila melanogaster, entraînant l'inactivation du gène y dans certains tissus, mais le gène y était toujours actif dans certains tissus, car il y avait une séquence isolante à une extrémité du gypsy. gypsy aura des effets différents sur l'activité des gènes lorsque gypsy est inséré à différents endroits du locus y. En effet, l'activité du gène y est régulée par quatre activateurs. Lorsque l'isolant est inséré juste en amont du promoteur, il bloque l'activation des gènes dans les tissus de la lame de l'aile et de la cuticule du corps (à partir de l'activateur en amont). Mais n'a pas bloqué l'expression du gène y (de l'amplificateur en aval) dans les soies et les griffes farsales.
Étant donné que certains activateurs sont en amont et certains en aval du promoteur, l'effet de l'isolant ne dépend pas de la position de l'isolant par rapport au promoteur. Par conséquent, la raison de la directivité de l'effet isolant n'est pas vraiment comprise. Deux loci se sont avérés affecter la fonction isolante d'une manière trans-activation. La nucléoprotéine codée par le gène S2J(Hw) reconnaît l'isolant, et ce n'est qu'après que l'isolant s'y est lié qu'elle a un effet isolant. Lorsque ce gène est muté, l'effet d'isolation est perdu malgré l'insertion d'un isolant dans le locus y, et y est exprimé dans tous les tissus. Un autre lieu est mod(mdg 4). Après mutation de ce gène, son effet est juste opposé à Su(Hw), c'est-à-dire que ces mutants renforcent l'effet d'isolation, rendant l'effet d'isolation de l'isolant non directionnel et élargi, c'est-à-dire bloquant l'effet des amplificateurs sur les deux côtés amont et aval.
